制作していただいたロゴマークのデータはホームページや印刷物で使いたいのですがどちらでも使えますか

使えます。

制作したデータは印刷用のデータ形式EPSとJPEG(印刷にも使用できますが、ラスターデータなので大きくきれいに印刷しようとすると印刷物には向きません)でお渡しいたしますので用途に分けたお使い下さい。